政府正全力進行潛艦國造，但海軍艦長黃征輝近來不斷以筆名「黃河」，在個人部落格撰文對潛艦國造提出諸多質疑，認為拿下技術顧問標的直布羅陀GL公司手上的輸出許可，可能是「一場騙局」外，還指控海軍司令黃曙光透過哥哥黃晨光，請曾因尹清楓案被調查的郭璽代為在國際尋找IDS商源，「在灰色地帶殺出一條血路」，他並認為海軍司令部居然聘請郭璽擔任顧問，令人難以置信。
對此，海軍司令部今天(19日)發布新聞稿表示，潛艦國造是國防自主的重大政策，潛艦是捍衛國家安全可恃的「不對稱戰力」，歷經十餘載循正式管道潛艦的籌獲均未能如願，思考在合法的範圍內運用非正式的管道尋求商源，迄今突破困局已略具雛形，目前海軍全依期程與風險管理落實執行造艦規劃。外界認為，軍方首度證實對潛艦國造，採取「在合法範圍內運用非正式管道尋求商源」。
海軍司令部並說，近來有心人士疑似軍火代理商，在媒體評論或撰寫公開訊息之內容，有諸多與現況事實不符，多為個人不當揣測，所發表主張試圖曝光破壞全案，動機可議。
海軍司令部也強調，潛艦國造案目前在主合約商台船努力突破下，已依專案進度執行，軍方全程均配合國會監督，依法行政，可受社會公評。