日本厚生勞動省派人在菲律賓收集二次世界大戰期間日本兵的遺骨，保管於菲國，7年前受委託針對這些遺骨進行DNA鑑定的兩名專家表示，鑑定結果完全沒有日本人的遺骨。
日本放送協會(NHK)報導，厚勞省委託人在菲律賓收集到的遺骨有311具，分成三部分，委由3位專家進行DNA鑑定，2011年10月公布了一份以其中一位專家所進行的鑑定結果為基礎的檢證報告。
這份報告記載：「遺骨當中將近半數混入看似是菲律賓人的遺骨，但也有看似是日本人的遺骨。」
不過，NHK採訪後得知，當年厚勞省公布檢證報告後，3位名專家當中的其他兩位專家所做的鑑定結果是可辨識的遺骨幾乎都是菲律賓人的遺骨，沒有日本人的遺骨。
NHK獨家取得的鑑定結果顯示，其中1位專家鑑定了71具遺骨的結果，認為能辨識的遺骨幾乎都是菲律賓人的遺骨，沒日本人的遺骨。另一位專家表示，鑑定了110具遺骨的結果，也認為沒日本人的遺骨。
有關二戰期間戰死於菲律賓的日軍遺骨的收集作業，厚勞省於2009年度後，委託日本的非營利組織(NPO)法人進行收集，但被指出遺骨中可能混了菲律賓人的遺骨，2010年就中斷收集作業。
厚勞省今年5月公布，事隔8年將重啟在菲律賓收集遺骨的作業，但都沒公布上述兩位專家鑑定結果。
有關NPO法人所收集且已被歸還日本的遺骨，因菲律賓已發出證明書，所以厚勞省的說明是，不認為遺骨中有混入菲律賓人的遺骨。
山梨大學教授安達登對NHK表示，進行遺骨DNA鑑定後，都沒日本人的遺骨。他不知厚勞省為何不公布他做的鑑定報告。他認為，厚勞省明明委託了三名專家做鑑定，卻只公布一名專家的鑑定結果，若被認為是操作資訊、企圖掩蓋真相，那也沒輒。
對此，厚勞省表示，2011年公布檢證結果時，只有一名專家的鑑定結果出爐，其他二名專家的結果還沒彙整。公布的結果顯示，收集到的遺骨當中有日本人的遺骨，這也是事實，並沒企圖掩蓋。
今年5月厚勞省表示，2011年的檢證結果顯示，不認為已歸還的遺骨中混有菲律賓人遺骨。厚勞省認為，已被歸還給日本的遺骨都有菲律賓發出的證明，判斷是日本兵的遺骨。
報導說，在菲律賓戰亡的日本人約有52萬人，現在還有37萬人的遺骨還留在當地。日本政府於1957年開始進行收集日軍遺骨的作業，當初有厚勞省官員到場會勘，由菲律賓人類學家判斷是否為日本人的遺骨，共收集了10萬人以上的遺骨。
但後來所獲資訊有限，1年之間收集到遺骨僅數十人的遺骨。厚勞省於2009年起委由NPO法人進行收集遺骨作業，結果收集到的遺骨數大增，2009年度收集到7,740人、2010年收集到6,289人的遺骨。