針對校長遴選風波，國立台灣大學今天(4日)正式向教育部提出訴願。對此，教育部代理部長姚立德表示，尊重台大的做法，同時期盼透過司法程序，能平息兩邊的紛爭，最終無論結果為何，教育部都會尊重。

台灣大學對於教育部未能依大學法規定聘任新校長，4日再發聲明，表達遺憾與強烈異議，並宣布將遵行臨時校務會議的決議，委請律師正式提出訴願，以釐清法律爭議，並捍衛學校校長遴選的自主性。
對此，教育部代理部長姚立德表示，因為教育部和台大互有立場，最後就透過訴願，讓法官做最後裁決，這樣也才能平息兩邊的紛爭，畢竟法律是最後一道防線。
姚立德強調，後續無論是行政院的訴願委員會有所決定，或是行政法院有所裁決，教育部都將尊重最後結果。姚立德：『(原音)教育部也會很期待說，因為這是最後一道程序，那不管怎樣，教育部都一定會尊重最後的結果，那當然也期待台大這邊，也能夠去尊重最後這樣的結果。』
姚立德說，期盼藉由法律程序將這件事情理性解決，大家繼續往前走。