教育部長吳茂昆今天(24日)到立法院教育及文化委員會備詢，對於國內高中生今年申請到中國大陸高校就學的人數暴增，吳茂昆表示，看到這樣的情況，確實需要檢討台灣的高教現況，因此，他也請求朝野立委能解凍教育部高教預算新台幣30億元，讓我國高教能獲得更好的運作。

教育部長吳茂昆前往立法院教育及文化委員會進行教育部預算解凍報告，陳學聖、賴士葆等多名國民黨立委再次圍堵吳茂昆，要求下台。陳學聖：『(原音)部長，不可以這樣子，連高中你都不放過，大學不放過，高中也不放過，部長，你怎麼可以這樣子呢？』
國民黨立委不滿教育部放任相關人員到武陵高中等校，關切高三生申請赴中國就讀高校的人數暴增；吳茂昆回應，教育部人員只是去了解，不是調查，而他最近也有聽聞有學生錄取台灣大學機械系，卻選擇就讀上海交通大學，所以也覺得教育部應當檢討現行的高教策略。吳茂昆：『(原音)這兩天我們當然是看到一些學生到中國求學的問題，這讓我們也深刻感受到我們教育部確實是需要反省檢討一下我們的高教現況，那麼今天請求各位委員針對這個解凍案能夠來支持，因為裡面確實有不少的資源是跟高教的運作是相關的。』
立委柯志恩則是針對台大校長管中閔聘任案，再次要求吳茂昆對現在的僵局表態。柯志恩：『(原音)那我現在請問你，台大如果不重啟遴選的話，教育部是不是要迎戰到底？(吳茂昆：我們就是一直希望它遴選委員會再重新補正。)那我問個最簡單的問題，你覺得管中閔還有沒有辦法再被提名當校長？(吳茂昆：我們一直是說，他可以進去到遴選委員會遴選。)但是你不要忘記喔，我們看前面一個，我來先幫你回憶一下。』
講完台大案，柯志恩再爆吳茂昆的自身爭議，指出吳茂昆在2005年10月擔任國科會主委時，去中國蘇州參加國際科學理事會，但後來又到杭州參與高新技術高峰論壇，這部分並沒有申報，明顯違法。柯志恩：『(原音)你沒有申請！(吳茂昆：我有申請！)你沒有！(吳茂昆：你要不要拿那個公文來看。)我馬上拿給你，如果你讓我查出來你沒有申請，你自己轉到杭州的話，你要怎麼辦？當場說！(吳茂昆：你如果查到沒有，你就告訴我。)然後你要怎麼辦？(吳茂昆：如果是真的違法，我已經講了，我違法就下台啊！)(柯志恩拍桌)你就是沒有！』
吳茂昆隨後改口表示，如果真有違法，就看行政院長賴清德要不要他下台。柯志恩則感嘆，她真的不曉得該為我國教育的百年大計，來想想吳茂昆真的不適任部長職務，還是應為國民黨的年底選戰，讓吳茂昆繼續留任，使她陷入天人交戰。

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