近年來跨境電商在台灣如雨後春筍，但這些無固定營業場所的境外電商，過去也對台灣產生稅基侵蝕的問題。財政部在去年5月針對跨境電商發布課稅規定。財政部長許虞哲在接受中央廣播電臺「早安‧台灣」節目專訪時，也呼籲這些電商遵守遊戲規則，否則台灣的稅捐機關，可以透過外交途徑或是和他國簽訂租稅協定的方式，協助追繳相關稅額。

過去台灣的個人或是企業，向跨境電商購買像是音樂串流、線上遊戲等勞務，財政部採取逆向課稅，也就是由購買者負責報繳營業稅，並給予新台幣3千元的免稅門檻，但由於一般買受人的觀念普遍不足，也造成稅收流失。
財政部於是參考歐盟、韓國和日本等國家，修正營業稅法，對跨境電商發布課稅規定。政策上路1年來，已經有包括知名訂房網Agoda、社群網站Facebook、Google等79家境外電商業者辦理稅籍登記，和政策早已上路多年的日本有80家業者的登記數比較，幾乎相當。境外電商辦理稅籍登記，也讓財政部掌握業者的銷售情況，從去年5月至今年2月共5期的營業稅銷售額就達到560多億，業者共繳稅24億多，為國庫帶來可觀進帳。
財政部長許虞哲在專訪時表示，目前財政部和各國一樣，都是以鼓勵方式輔導跨境電商辦理稅籍登記，但如果電商不遵守遊戲規則，台灣的稅捐機關仍會透過各種方式，追繳相關稅額。許虞哲說：『(原音)假如萬一它在這裏沒有辦理稅籍登記，國稅局透過外交部來協助送達，為落實業者申報課稅，也會列入查核對象。因為國外和國內還是比較不一樣，追稅比較困難，目前稅捐稽徵法有規定，我們可以和其他國家簽訂租稅協定，協助徵稅，和我們簽協定的現在有32個國家。』
財長也強調，建立跨境電商稅制，除了確保稅源，也讓跨境電商和國內業者，能夠更公平的競爭。

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