針對中國上海台辦主任李文輝來台一事，台北市長柯文哲認為台北市政府沒開旅行社，不會幫李文輝提出申請。行政院陸委會發言人邱垂正今天(22日)對此回應表示，台北市政府可以擔任兩岸交流的邀請單位並向移民署提出申請，過去台北主辦台北上海雙城論壇時，中國官員獲准來台就是由北市府提出申請，因此，如果北市府今年想要舉辦雙城論壇，只要提出申請，相關機關就會加以處理。

上海台辦主任李文輝申請來台遭拒，台北市長柯文哲表示過去都是找旅行社代辦送件審核，北市府沒有開旅行社，不會去幫李文輝處理申請事宜。
陸委會發言人邱垂正對此回應表示，台北市政府可擔任兩岸交流活動的邀請單位並提出申請，反而是一般旅行社不能擔任兩岸專業交流的邀請單位，事實上2016年在台北舉辦的雙城論壇，上海官員來台參加就是由台北市政府向移民署提出申請。
邱垂正指出，希望北市府幕僚能提供正確資訊給台北市長，陸委會也會主動向市府探詢是否需要協助或說明，若北市府幕僚有不清楚之處，也可與陸委會聯繫，邱垂正說：『(原音)對於兩岸間的城市交流，中央政府跟台北市政府是夥伴的關係，如果台北市政府今年要規劃舉辦雙城論壇，並提出相關人員來台申請案，主管機關內政部移民署將會同相關機關來加以協處。』
另一方面，關於前國發會主委、學者管中閔是否前往中國大陸兼職的問題，邱垂正表示，經洽移民署了解之後，管中閔從2005年到現在，共有28次申請赴陸記錄，其中21次由內政部許可、7次是由內政部審查會許可，但管中閔是否在中國大陸兼職兼課及有無違法等問題，應由他赴陸兼職期間的任職機關或主管機關加以釐清認定。