對於深澳電廠可能引發汙染的疑慮，行政院發言人徐國勇今天(19日)表示，深澳電廠使用的是乾淨的煤，且燃煤造成的汙染程度最重要是看後端，深澳電廠使用「超超臨界」機組發電，排放的汙染與天然氣電廠差不多。

深澳燃煤電廠環差案過關引發爭議，行政院長賴清德日前表示，深澳電廠用的是乾淨的煤，設備是「超超臨界」的機組，因此，排汙量與天然氣電廠差不多。不過，媒體報導指出，根據經濟部能源局統計，以「無煙煤」和「亞煙煤」為主的乾淨煤去年燃燒發電噸數創下5年來次低，而汙染高的燃料煤發電則創下新高。
對此，行政院發言人徐國勇19日受訪時表示，要改善燃煤電廠空汙排放，除了看前端、也要看後端，而且又以後端排放出去的部分最重要，賴清德18日在視察林口電廠時已指出，經過「超超臨界」的機組處理，排放出去的空氣與燃氣差不多。他說：『(原音)煤除了看前端，還要看後端，就是排放出去的才是最後、才是最重要的，所以排放出去，我們昨天已經在林口(電廠)講了，林口那個已經告訴你說，「超超臨界」它所進來的媒，經過「超超臨界」的機組，處理了以後，燒完了以後，出去的空氣是跟…，排放的是跟燃氣差不多，所以除了前端，還要再看後端啊，不能把後端給忽略掉。』
徐國勇指出，以使用「超超臨界」機組與「乾淨煤」發電的林口電廠而言，電廠每分每秒都在掌握排放物，且相關數據都與環保署連線，外界也可以看得很清楚，電廠上的煙囪沒有任何黑煙，與天然氣電廠的情況幾乎一樣。