死刑存廢議題爭議已久，法務部長邱太三表示，台灣終極目標是希望廢死，只是相關時程、步驟要怎麼做到；至於他會不會簽署死刑執行令，邱太三說，他上任至今，最高檢都還沒有送死刑執行案到法務部。
死刑存廢在社會上意見分歧，邱太三接受中央社專訪指出，前總統馬英九時代把「兩公約」(指「公民與政治權利國際公約」及「經濟社會文化權利國際公約」)國內法化，台灣接著簽了很多跟人權有關的公約，他自己也寫人權實施報告，請國際專家做評鑑、給建議；不過兩公約內相關死刑議題，沒有辦法強制所有國家來做，但是這是期待及未來的目標。
邱太三表示，不管是馬前總統還是蔡英文總統，台灣的終極目標是希望廢死，只是相關時程跟步驟要如何做到；他擔任法務部長後，要的是「執行死刑要慎重」。
目前有43名死刑犯待執行死刑，最高檢是否有送死刑執行案件到法務部批示；邱太三回答沒有。記者追問邱太三，如果死刑案經過高檢、最高檢檢視後送到法務部，是否就會簽署死刑執行令；他說，坦白說會看整體狀況，檢察官考量是純法律面，法務部則是要做綜合性考量，比如說檢察官不用考量跟人權公約的關聯度，法務部裡面要考量人權公約相關問題。