5日深夜一架空勤總隊的黑鷹直升機執行蘭嶼醫療後送，從蘭嶼起飛3分鐘後失聯。內政部長葉俊榮於今天(6日)凌晨1時許接獲空勤總隊總隊長董劍城及國搜中心主任陳文龍通報，在了解狀況後立即指示全力搜救。葉俊榮並於今日上午7時親至國搜中心及空勤總隊聽取簡報，了解任務當時天候、派遣情形及目前整體搜救作為，指示空勤總隊副總隊長王啟通前往台東成立前進指揮所，全力爭取救援時效，不放棄任何一絲希望，期間並向行政院長賴清德報告當前處置狀況。
5日深夜11時9分，空勤總隊一架UH-60M型號、編號NA-706的黑鷹直升機自台東起飛至蘭嶼執行EMS醫療後送任務，11時48分自蘭嶼起飛3分鐘後即失聯，且雷達訊號消失。機上共有6人，包括空勤正副駕駛2位、機工長1位、患者1名、家屬1名及護理人員1名。
國搜中心接獲通報後，立即派遣空勤總隊UH-60M型直升機及國防部EC-225型直升機接續起飛，執行搜救任務，6日凌晨1時3分空勤總隊UH-60M型黑鷹直升機自台東起飛，1時26分國防部EC-225型直升機從嘉義起飛；地面由蘭嶼警方、消防人員及岸巡人員於蘭嶼機場附近山區及岸際搜尋，海上由海軍康定艦及5艘海巡艦艇前往失事海域搜尋，各電臺也持續廣播附近船舶前往協尋。
國搜中心已規劃自今天上午5時至晚間8時30分，出動國防部搜救機及空勤總隊搜救機，每2小時1架次，合計7架次前往搜救，並協同地面警察、消防、岸巡人員，及海上海軍、海巡艦艇等搜救能量，積極執行海空搜救任務，盡全力爭取人命救援時效，不放棄任何一絲希望。