歐盟將台灣列為打擊非法捕撈漁業(IUU)不合作黃牌警告國家已2年多，原本農委會評估，在經過各項法規修正及加強執法後，去年10月歐盟派員來台複查，應可望解除，但歐盟卻認為，有些技術性問題仍待加強。漁業署署長黃鴻燕表示，歐盟希望台灣再改進的最後一哩路，漁業署正積極完成，對於歐盟3月將再派員來台，他也有信心，複驗一定會讓歐盟滿意，且進一步解除黃牌警告。

歐盟從2012年稽核各國打擊非法捕撈(IUU)情形，迄今已經有韓國和菲律賓等20多個國家，曾被認定或警告為打擊IUU不合作國家，台灣也於2015年10月遭歐盟列為黃牌警告國家，去年10月歐盟也對海鮮出口大國越南發出黃牌警告，如果沒有改善，歐盟將指認為不合作第三國，也就是舉紅牌，屆時將禁止水產品進口歐盟。
台灣為能解除歐盟黃牌警告，去年1月20日新法上路後，針對漁民各項違法態樣重罰，至去年10月下旬，已經開罰40件，且罰款金額最少就是新台幣50萬，不少都是上百萬的案件。不過，歐盟去年10月下旬來台複查時，指出舊法對於漁民處1個月不能作業所影響的收益，和新法改為判處罰金的金額，兩者相較是否有等同效益；以及罰金是否有超過漁民的不法利得，能否達嚇阻效果的執法等技術性問題仍存有質疑。
漁業署署長黃鴻燕受訪表示，台灣上千艘遠洋漁船終年在海外，由於新法去年才剛上路，法令宣導不易，因此歐盟認為政府對於執法仍稍有寬鬆，不過，漁業署這幾個月已經加強執法，短短2個月，又增加20個裁罰案件，透過重罰，漁民近期改善速度也加快，他也相信，歐盟3月將再度來台，必定會對於改善部分滿意。黃鴻燕說：『(原音)把最後一哩路，他們要我們再提升的部分，要來完成，讓他滿意，還是要經過他們的檢驗，但是我們自己有信心，希望他這次來以後回去，雖然他們有內部流程，但我們有信心會有好消息。』
歐盟執委會環境、海洋與漁業人員，也曾多次對外說明，全球每年的漁獲量從2,600萬噸至1億噸不等，但卻有至少15%來自於非法捕撈，歐盟認為做為世界最大的魚類進口國，不希望自己成為共犯，或是接受此類型漁獲進入市場。黃鴻燕也表示，透過歐盟給台灣動力，相信台灣遠洋漁業也會做得更好。