颱風尼莎來勢洶洶，台鐵28日晚上宣布，今天(29日)中午12時前東部幹線、南迴線有多班對號列車停駛，區間車機動行駛；台灣高鐵表示，29日晚間6時前正常營運。
台鐵宣布，29日中午12時前東部幹線和南迴線對號列車多數停駛，區間車視風雨機動行駛，西部幹線正常營運，提醒有計畫搭台鐵民眾留意。
台鐵對號列車停駛情形如下：
1.台北往台東，自408次自強號(台北站7時40分開)開行後，全部停駛。
2.台北往花蓮，自280次自強號(台北站9時40分開)開行後，全部停駛。
3.台東、花蓮往台北，自411次普悠瑪號(台東站7時55分開)、(花蓮站9時44分開)開行後，全部停駛。
4.新左營往台東，自371次自強號(新左營09時20分開)開行後，全部停駛。
5.台東往新左營，自308次自強號(台東11時10分開)開行後，全部停駛。
高鐵方面，台灣高鐵公司表示，29日晚間6時前全線維持正常營運，各車次列車依時刻表發車，至於晚間6時後營運狀況，今天上午10時前宣布。