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為了防堵共諜滲透，考試院會日前通過行政院人事行政總處會銜的「國家安全或重大利益公務人員特殊查核辦法」修正草案，增加特殊查核的頻率與職務範圍；相關規定6日生效。行政院發言人李慧芝今天(5日)表示，行政院長、副院長、秘書長，及2位副秘書長將列首波查核對象。
人事總處培訓考用處處長李花書5日在行政院會後記者會上表示，查核辦法4日發布，依法將於6日生效，修正內容包括，配合國安五法修正，將涉及國安五法的重大國安犯罪類型列為特查項目之一；修法增加查核頻次，特查職務滿一定期間要定期辦理特查。
李花書指出，相關首長辦公室裡面的人員若非公務人員任用法適用範疇，則會請他們填寫自願書，確實完備國家安全查核。
李慧芝也表示，政院五長以及其辦公室所有人員都會優先辦理首波特殊查核。至於查核期程，李花書表示，5日起就會陸續啟動查核，但特殊查核期程要送調查局辦理，需要一點時間。
行政院公告辦法提及，考量威脅國家安全或重大利益的境外敵對勢力，除外國情治單位、大陸地區或香港、澳門官方或其代表機構外，國內近年陸續偵辦多起國安犯罪案件型態，顯示滲透來源已擴及境外敵對勢力實際控制或管理的具政治性機關(構)、團體或其派遣者，因此此次也增列「未經許可或授權，曾與具政治性機關(構)、團體或其派遣之人聯繫接觸者」或是受其利誘、脅迫者，皆納入查核範圍。
公告辦法也指出，同居關係屬現代重要生活型態，且同居人雖非配偶，惟其與當事人的生活關係相當緊密，引此此次將受特殊查核公務人員的同居人，以及同居人的父母列為調查範圍。
查核辦法也明定，經特殊查核有相關情事者，法務部調查局得經當事人書面同意後，蒐集其財稅、信用卡、銀行存款、債務、授信及匯款紀錄等財務資訊。當事人不同意者，擬任人員應不得任用為前條所定職務，但可擔任前條以外的職務；現職人員除機要人員應免其機要職務外，應依法調整為前條以外的職務。
國防部修正「國軍人事資料查核運用作業規定」，新增初、新任，及預劃從事及參與國防安全事務人員，送請保防單位查詢國籍與刑案紀錄的規定。其中涉密人員的特殊查核作業，需填寫查核表且當面訪談，並新增視情況施予科學儀測。
國防部政戰局保防安全處處長簡熒宏在行政院表示，國軍涉密查核，會要求受查人填寫特殊查核表，經過相關部會審查，如有疑義會請當事人書面說明，比對相關資料若還有疑義，會進行面訪，若還是沒說明，會用測謊儀進行科學儀測。