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今年度中央政府總預算被大幅刪減或凍結，主計總處今天(13日)在行政院會報告12項窒礙難行之處。
第一，刪減總數未宣讀，往年立法院總預算案三讀內容，均包含總刪減數及審查後歲出總額，但這次三讀並未明確宣讀總刪減數及審查後歲出總額，依宣讀內容計算刪減新台幣2,076億元，但經主計總處計算僅刪減1,439億元，造成審查後歲出數額混亂有爭議。第二，部分刪減提案的刪減數已超過原編預算案數，超刪總數7,191萬3,000元。以外交部為例，編列「媒體政策及業務宣導費」1億1,127萬元，依立法院計算刪減總數達1億4,080萬5,000元，已超出預算數2,953萬5,000元，顯不合理。
第三，刪減總數創歷史新高，今年度總預算案刪減數2,076億元(未宣讀)、刪減率6.6%，較前3年平均刪減數291億元、刪減率1.1%，大幅增加1,785億元，約增加6倍。
第四，要求行政院自行調整刪減數高達636億554萬7,000元。但依立法院決議，通案統刪數不低於939億7,500萬元，扣除已核實計算的通刪數303億6,945萬3,000元，行政院還須自行調整刪減數636億554萬7,000元，自行調整刪減數額過於龐大，行政院已無力再行調減。並且，按憲法第58條、第59條及第63條規定，行政院有預算案編製與提案權，而立法院有預算審議權，此乃憲法權力分立原理，憲法賦予各機關特定權限，各機關即負有行使該權限之義務與責任；不過，這次總預算審議結果拋棄憲法所託付的預算審議權限，與憲法權力分立原理顯有不符。
另外，審議結果將造成預算刪減政治責任歸屬不明確，有違司法院大法官釋字第391號解釋所強調的責任政治原則；且不符預算法第49條，立法院審議歲出預算，應就機關別、政事別及基金別決定。
第五，凍結總數創近年新高，經主計總處核算，凍結數高達1,381億元，約4.6%，較前3年平均凍結數140億元，約0.5%，大幅增加1,241億元，約增加9倍。因凍結預算具高度不確定性，未來執行時將影響廠商參與投標意願，不利相關標案及業務之推動。
第六，多項凍結案解的凍條件難以達成，將造成機關運作無法延續，因解凍相關程序冗長，在立法院同意解凍前，經費將無法動支，屆時將造成機關基本維運無法延續，產生業務執行空窗期，影響政府運作及人民權益。第七，刪減凍結集中特定機關業務費，已嚴重影響機關基本運作維持，及依據憲法或法律執行各項業務。
第八，刪減集中特定項目，例如中國地區旅費統刪80%，國外旅費及出國教育訓練費統刪60%，將嚴重影響台灣與國際的連結，包括毒品走私、電信詐欺、洗錢防制、國際金融監管單位合作，資安以及體育外交都將受到影響。另外，媒體政策及業務宣導費刪減60%，也將弱化政府與人民溝通說明重大政策的能力。
第九，政策宣導單一廠商得標金額不得超過5%，無正當理由限縮廠商不得參與機關採購案投標，以50萬元預算為例，可能要分別由20家的廠商得標，每標案僅2.5萬元，與現實嚴重脫節。
第十，一般事務費通刪10%為往年2至3倍，且未考慮各機關實際業務差異及辦理必要性，即予以通盤減列，將導致國家各機關用人政策及重要業務推展窒礙。第十一，原民會凍結案違反大法官釋字第391號，解凍條件涉及增加預算數額或調整預算支用內容，違反大法官釋字第391號解釋意旨，使責任政治難以建立，有違行政權與立法權分立。
最後，部分通刪項目(國外旅費及出國教育訓練費、國內旅費、特別費)設有不得流用之限制，且指定刪減項目未授權科目自行調整，造成預算執行無法因應情勢變化及實際需要，辦理預算流用及動支預備金，使預算執行無彈性，影響業務推動。