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首批BNT疫苗今天(2日)抵台，學生族群最快9月中開始接種，恐和10月份公費流感疫苗接種撞期。對此，中央流行疫情指揮中心發言人莊人祥表示，根據衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組(ACIP)委員建議，無論接種哪種疫苗，只要與COVID-19疫苗間隔7天即可，用以分辨不良反應。
莊人祥指出，過去規定接種完兩劑COVID-19疫苗後，才能接種其他疫苗，但近期參考他國做法，ACIP委員建議，無論施打哪種疫苗，只要間隔7天即可接種，除了避免疫苗的交叉反應，也才能釐清不良反應。
莊人祥並指出，之前有些醫師認為某些疾病不適合打某類型的COVID-19疫苗，但指揮中心陸續蒐集各醫學會的建議，各醫學會皆認為現在並無任何一種疾病不適合施打某種特定疫苗，指揮中心也有將相關資料提供各衛生局參考。
此外，學生接種BNT疫苗皆須取得家長同意書，媒體詢問，若家長簽署同意書，但當事人不想接種，該如何處理？對此，指揮中心疫情監測組組長周志浩表示，當事人當然可以拒絕接種，但要打就一定要有家長同意書。