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行政院環境保護署表示，針對4日指揮中心發出多處風景區警報，大多都已完成消毒作業；由於預估人潮將北返，因此今天(5日)下午會再針對台北車站、永康、西門商圈等，再次進行消毒。
中央流行疫情指揮中心昨天對多處景點發出2則國家級警報，第一則是針對一般景點如阿里山森林遊樂區、花蓮東大門夜市、嘉義文化路、台南關子嶺、虎頭埤、烏山頭水庫及湖境渡假會館等埤塘風景區、高雄興達港、旗山老街、雲林北港朝天宮等。第二則是針對屏東縣南州鄉以南(含墾丁觀光景點)。
為加強防疫，環保署今天表示，簡訊中通報的重點地區如墾丁大街、恆春熱點已經在今天上午完成消毒；北港朝天宮及其他上述風景區也大多已上午完成消毒作業；花蓮東大門夜市更在連假期間上下午各消毒一次。
台南關子嶺、虎頭埤會在今天下午進行消毒作業；此外，由於預計人潮今天將北返，因此北市環保署預計下午將針對台北車站、永康、西門商圈等再次進行消毒。
根據各地方回報統計，在連假期間，已消毒的交通場站有205處，人潮聚集240處，其他學校周邊也都進行消毒，總共合計達863個地點。環保署指出，啟動消毒主要還是著重在預防，防疫消毒大隊主要都是針對戶外區域執行作業，營業場所內部仍希望業者能配合消毒。