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教育部本週同意管中閔擔任國立台灣大學校長，台大安排讓管中閔在1月8日就任。教育部今天(28日)傍晚發布新聞稿表示，關於台大校方、管中閔及台大學生，日前分別對教育部在5月4日請台大進行遴選程序瑕疵補正的公文提起訴願，今天(28日)已收到行政院訴願決定書，行政院對這三件訴願案均作成「訴願不受理」的決定。
教育部說明，行政院在3件訴願案的訴願決定書特別指出，教育部5月4日函請台大補正遴選程序瑕疵，是教育部作成行政處分前的程序處置，目的是為了確保將來新任校長當選人的合法性、正當性及任期中的穩定性，故此函並非行政處分，在此情況下，包括台大校方、管中閔及台大學生對此提起訴願，依法未合，所以行政院訴願會決定不受理。
教育部強調，這次台大校長遴選過程，由於相關資訊未充分揭露，造成利益迴避事宜未能在遴選過程適度討論，而遭到質疑遴選結果的公正性，台大及校長遴選委員會確實應深切檢討反省；教育部在衡量遴選瑕疵特性、校務發展等情況，對大學自主給予最高尊重下，作成「勉予聘任」決定的同時，也督促台大對遴選過程爭議徹底檢討，並透過校長遴選制度整體檢視與調整，杜絕類似紛爭，以符合當前高教競爭發展的需要。